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有些增强子位于启动子上游，有些位于下游，所以龙门冲床的效应并不取决于龙门冲床同启动子的相对位置。因此，对龙门冲床效应的方向性的原因还没有真正弄清楚。目前已发现有两个基因座以反式活化方式影响龙门冲床的功能。基因S2J(Hw)编码的核蛋白识别龙门冲床，龙门冲床同其结合后才有绝缘作用。当该基因突变后，尽管y基因座中插入了龙门冲床，但失去了绝缘作用，y在所有组织中都表达。另一个基因座是mod(mdg 4)，该基因发生突变后，其效应正好与Su(Hw)相反，即这些突变型都增强了绝缘作用，使龙门冲床的绝缘效应不再有方向性而得到扩展，也就是阻断了上游和下游两侧的增强子的效应。
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